По версии следствия, в 2017 году директор ФСНКЦ обратился к своему знакомому - директору коммерческой компании с предложением о передаче ему на постоянной основе взяток за содействие в организации систематического заключения контрактов на поставку медицинских изделий, обеспечение компании победы в конкурсе, а также выполнение заключенных контрактов.

С января 2017 по 2022 годы, директор ФСНКЦ организовал выбор коммерческой компании в качестве поставщика, а также заключение и подписание контрактов, всего более 85. За выполнение незаконных действий в период генеральный директор ФСНКЦ получил от директора коммерческой компании взятку частями в общей сумме более 16,5 миллионов рублей. Бывший директор ФСНКЦ задержан. Взяткодатель заключен под стражу.

В настоящее время в отношении бывшего генерального директора ФСНКЦ ФМБА России в суде рассматривается уголовное дело о хищении путем растраты денежных средств, совершенном организованной группой в особо крупном размере при поставке лекарственных препаратов для нужд бюджетного учреждения в сумме 15,5 миллионов рублей.